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    2020-06-30 12:09:50
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1972

Ribo-off rRNA depletion kit(Plant)

價格:
10800.0
市場價
10800.0
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貨號:
N409-01/02
所屬分類
RNA模塊
數量:
-
+
庫存:
19998
暫時無貨
1
產品詳情
FAQ
組分
說明書

 Ribo-off® rRNA depletion kit(Plant)

植物去除rRNA試劑盒

兼容性強:能兼容多種植物物種,同時針對植物的不同部位(根、種子和葉片)也具有良好的兼容性。

rRNA殘留率低:針對不同物種均能有效去除rRNA

1.低的rRNA殘留率

針對不同物種,Vazyme N409均能有效去除rRNA,最大程度減少rRNA的殘留導致的數據浪費,且去除效率優于illumina同類產品。

2.優秀的數據質量

對下機數據過濾后得到的高質量clean reads,根據參考序列使用HISAT2軟件對序列進行比對分析,得到mapping rate。Vazyme N409搭配后續的建庫模塊的下機數據,在Mapping rate上優于illumina。

Ribo-off® rRNA depletion kit (Plant)是針對植物根、種子和葉片總RNA中去除rRNA的試劑盒。本試劑盒適用于模板起始量為1 - 5 μg的植物總RNA,總RNA樣本經過rRNA與探針雜交、RNase H消化、DNaseⅠ消化等步驟,最終將rRNA(包括5S、18S和25S rRNA)從總RNA中去除,保留mRNA和其它非編碼RNA,可用于LncRNA等非編碼RNA的分析;試劑盒額外提供了靶向線粒體rRNA和葉綠體rRNA的消化探針,可以高效去除多種植物種屬主要的rRNA,提供信息最充實的測序結果。該試劑盒同時適用于完整的和部分降解的RNA樣本,所得的產物適用于RNA文庫及其他實驗。

組分 N409-01 (12 rxn) N409-02 (24 rxn)
rRNA Probe (Plant) 24 μl 48 μl
Probe Buffer 36 μl 72 μl
RNase H Buffer 48 μl 96 μl
RNase H 12 μl 24 μl
DNaseⅠBuffer 348 μl 696 μl
DNaseⅠ 12 μl 24 μl
Nuclease-free ddH2O 1 ml 2 × 1 ml

-30°C~-15°C保存

未找到相應參數組,請于后臺屬性模板中添加

1.如果純化產物用于文庫構建,但是使用的是Nuclease-free H2O洗脫的,如何操作?

若條件允許,加入等體積2 × Frag/Prime Buffer (Vazyme #N402),之后反應體系均放大,直至做到純化步驟,恢復體系,也可以再次使用VAHTS® RNA Clean Beads (Vazyme#N412)進行純化,最后用Frag/Prime Buffer洗脫。

2.純化產物可以保存多久?

純化產物由于濃度較低容易降解,去除rRNA的樣品應盡快進行下游實驗,否則請-80 ~ -65℃保存。

3.如果文庫濃度過低,可以從哪些角度去尋找原因并如何改進?

以高質量的RNA樣品為模板構建得到的文庫濃度都能達到上機測序要求,如果無法提供合格的RNA樣品,可嘗試使用下方法彌補:

①起始量:提高樣品起始量,最大可做到5 μg;

②做幾個重復的樣品,到純化步驟合并在一起,或做到文庫擴增前合并在一起;

③做不分選方案:94℃ ,8 min打斷條件下RNA片段雖然偏小,但是分布會很集中,均一性也較好,有些個性化樣品會出現打斷不均一、某些大小的片段較多,經過PCR更明顯,出現刺峰,這種情況在不分選方案中出現很少。

 

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